GBIS에 노선도와 차량 위치는 뜨나, 첫/막차나 배차간격 등이 제대로 뜨지 않고, 제대로 지켜지지도 않는다. 모체인 82-1번 개통 당시와 비슷한 셈. 다만 이 부분은 개선되었고, 2대로만 운행하기 때문에 20분 간격이라고 보면 된다.
상현역에서 유턴하기 때문에, 양쪽 정류장에 양방향 차량이 모두 정차하니 주의. 이런 것도 82-1번과 똑같다. 성복역 연장 이후 독바위 구간이 단축되어 기종점이 상현역으로 변경되었다. 그러므로 양방향 정차를 하지 않는다.
2016년 말부터 상현역~독바위 종점이 무단으로 파행운행이 되고 있었다.[6] 이후 주민들의 지속적인 민원으로 현재는 정상적으로 운행되고 있다가 성복역 연장과 함께 단축. 이후 6월 1일에 400, 400A번 노선이 연장되면서 상현역~독바위가는 노선이 다시 생겼다. 다만 독바위 안으로 들어가지 않는다.
2023년 10월 경 지선노선인 99-1번이 개통되었으며, 본선과는 달리 상현LG자이아파트를 경유하지 않는다. 이는 LG자이 아파트 경유에 따른 레이크포레 아파트의 민원때문에 신설된 것이라고 하며, 해당 노선의 노선과 관련하여 여전히 분쟁 중이다.